В систему команд модели входят 25 инструкций:

• операции с прямой или косвенной адресацей памяти
• операции с фиксированными регистрами (включая переходы)
• операции ввода/вывода и управление прерываниями

Все инструкции кодируются 16-битным словом, причем в инструкциях, которые содержат обращение к памяти, 4 бита отводится под код операции и 12 оставшихся - под адрес.

Мнем.	Код	Действия	Комментерии
AND ad	d000 aaaaaaaaaaaa	A <== A & (ad)	d=0 - прямая адресация, d=1 - косвенная aaaaaaaaaaaa - 12-битный адрес
ADD ad	d001 aaaaaaaaaaaa	A <== A + (ad)	устанавливает перенос
LDA ad	d010 aaaaaaaaaaaa	A <== (ad)
STA ad	d011 aaaaaaaaaaaa	(ad) <== A
BUN ad	d100 aaaaaaaaaaaa	PC <== ad	безусловный переход
BSA ad	d101 aaaaaaaaaaaa	(ad) <== PC	запоминание счетчика команд
ISZ ad	d110 aaaaaaaaaaaa	(ad) <== (ad)+1; skip if =0	пропустить след. инструк. если сумма=0
CLA	0111 100000000000	A <== 0
CLE	0111 010000000000	C {бит переноса} <== 0
CMA	0111 001000000000	A <== NOT A
CME	0111 000100000000	C <== NOT C	инвертировать бит переноса
CIR	0111 000010000000	циклич. сдвиг A вправо	через бит переноса
CIL	0111 000001000000	циклич. сдвиг A влево	через бит переноса
INC	0111 000000100000	A <== A + 1	не влияет на бит переноса
SPA	0111 000000010000	skip if A>0	пропустить след. инструк. если A>0
SNA	0111 000000001000	skip if A<0	пропустить след. инструк. если A<0
SZA	0111 000000000100	skip if A=0	пропустить след. инструк. если A=0
SZE	0111 000000000010	skip if C=0	пропустить след. инструк. если C=0
HLT	0111 000000000001	H <== 0	стоп
INP	1111 100000000000	A <== bus	ввод байта с шины
OUT	1111 010000000000	bus <== A	вывод байта на шину
SCI	1111 001000000000	skip if I=1 {флаг ввода}	пропустить след. инструк. если I=1
SCO	1111 000100000000	skip if O=1 {флаг вывода}	пропустить след. инструк. если O=1
ION	1111 000010000000	включить прерывания
IOF	1111 000001000000	отключить прерывания

Стоит заметить, что модель предназначается в первую очередь для изучения аппаратной части. Это заметно и по построению системы команд: коды операций назначены так, что многие распознаются по собственному биту (подобная мера сильно облегчает дешифрацию); заметное внимание уделено командам ввода/вывода. В то же время, видимо, опять таки ради простоты аппаратной реализации, принята весьма "нетрадиционная" схема реализации условных переходов - пропуск следующей инструкции при выполнении условия, а не переход на требуемый адрес.